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分子模拟管理系统（Molecular simulation management system）是指可以对分子模拟计算及相关数据进行统一管理和分析的软件系统。在分子模拟中，需要对大量的分子结构和物性数据进行处理和管理，这个过程需要通过计算机软件系统来完成。分子模拟管理系统可以帮助研究人员有效地组织和处理分子模拟计算数据，快速分析、挖掘和梳理分子模拟计算结果，提高研究效率和准确性。它在材料、化学、生物等领域有着广泛应用。
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